Действительно репозиториии разные, Как правило П.О. под линукс предоставляется в бинарниках (скомпилированный код) и исходниках (исходный код программы).
Применяется несколько специальных упаковочных форматов (RPM, DEB), позволяющих распространять программы в пакетах для разных дистрибутивов.
Самая простая установка программ из RPM, DEB пакетов, для этого в дистрибутивах есть инсталлятор для бинарных пакетов, установка проходит в автоматическом режиме. С исходным кодом дело посложнее. Для установки программы надо собрать, скомпилировать исходный код, Для этого переходим в каталог исходников и в файле INSTALL или README содержится важная информация о том, как устанавливать и использовать данную программу.

В большинстве случаях необходимо выполнить лишь одну команду: {./configure}. Эта команда проверяет наличие всех библиотек и других программ в системе, и подготовит исходный код к их использованию. Символы {./} указывают, что выполнение configure будет происходить из текущего каталога.

Теория. В операционной системе Linux (в основном) используется программа make, запускающая инструкцию из Makefile.

На этапе конфигурирования можно указать, куда ставить программу. Рекомендуемым для этих целей является каталог {/usr/local}, доступный только для администраторов компьютера. Но а пользователю устанавливать программу лучше всего в свой домашний каталог, указав дополнительные параметры: {./configure –prefix=$HOME}. Prefix указывает какой каталог использовать для установки.

Внимательно просмотрев все сообщения на экране, и убедившись в отсутствие ошибок, если есть ошибки – в Вашей системе недостает каких-либо компонентов, можно приступать к процессу сборки программы. Для этого введите команду {make}.

Сборка программы обычно длится достаточно продолжительное время, которое можно скоротать за раскладкой пасьянса или бороздя просторы бескрайнего интернета.

По завершению сборки, при условии отсутствия в ней ошибок, что случается крайне редко, вводим команду {make install}. При работе от пользователя компьютера перед make install нужно ввести команду sudo, дающей нам временно права суперпользователя ({sudo make install}).

Если Вами был выбран домашний каталог, как место установки программы, то необходимо ввести следующее: {export PATH=$HOME/bin:$PATH}, что добавит подкаталог ~/bin в переменную PATH.

На этом все, можете запускать программу.

SUDO - дословно «выполнить от имени суперпользователя (администратора). Команда sudo предоставляет возможность пользователям выполнять команды от имени root, либо других пользователей. Большинство обычных задач в Линуксе можно выполнять и без терминала.... ;)